PPP項目公司的資金來源一方面為PPP項目公司的注冊資本金，主要用于項目總投資中由投資者認繳的出資額，對投資項目來說屬于非債務性資金。由于PPP項目通常伴隨著大量的固定資產投資，因而必須滿足固定資產投資項目資本金的要求。2015年9月，國務院重新修訂發布的《關于調整和完善固定資產投資項目資本金制度的通知》規定了項目資本金的最低要求，如城市軌道交通項目為20%，港口、沿海及內河航運為25%等。PPP項目公司的資金來源一般包括自有資金、產業基金、國家政策性專項基金、財政撥款、二次抵押融資貸款、融資債券等。

另一方面為債務性資金，主要包括銀行貸款、債券、融資租賃，保險債權計劃等。